شبکه عصبی در بیو انفورماتیک
تعداد صفحات : 55 با فرمت ورد و قابل ویرایش
برای نیل به خودکفایی و تحکیم استقلال کشورمان، تخصص در همه زمینه ها امری لازم و اجتناب ناپذیر است. شبکه های عصبی مصنوعی از مباحث جدیدی است که دانشمندان علوم کامپیوتر به آن علاقه¬مند شده اند و برای پیشرفت هرچه بیشتر علوم کامپیوتر وقت و هزینه بسیاری را صرف آن کرده و می¬کنند. این موضوع با ایده گرفتن از سیستم عصبی بدن انسان و با هدف شبیه سازی هرچه بیشتر کامپیوتر به انسان شکل گرفت، از طرفی نیز در چند دهه اخیر با مطالعه بر موجودات می توان داده های زیادی را جمع¬آوری نمود مانند: داده¬های ژنومی، ژن ها و ... . با علم بیوانفورماتیک این داده¬ها در بانک¬های اطلاعاتی نگهداری، ذخیره و بازیابی می¬شوند و با ابزارهای کامپیوتری آنالیز و تحلیل می¬شوند. لازم است بدانیم که شبکه عصبی یکی از گسترده ترین روش¬های مورد استفاده در بیوانفورماتیک است. شبکه عصبی در پیش بینی ساختار ژن، پیش بینی ساختار پروتئین ، تجزیه و تحلیل داده¬های بیان ژن استفاده می شود و یا تقریبا هر کجا که نیاز به انجام طبقه بندی داشته باشیم. در این تحقیق سعی شده با زبانی ساده مطالب به ترتیبی ارائه شوند که در ابتدا مفاهیم اولیه شبکه عصبی و بیوانفورماتیک عنوان شود و سپس کاربرد شبکه عصبی در بیوانفورماتیک را تشریح نماییم.
1. فصل اول:شبکه عصبی.6
1.1مقدمه .6
1.2شبکه عصبی چیست7
1.3شبکه عصبی زیستی7
1.4نرون طبیعی7
1.5شبکه عصبی مصنوعی10
1.6نرون مصنوعی10
1.7ﮐﻴﻔﻴﺖ ﭘﺮﺩﺍﺯﺵ ﺍﻃﻼﻋﺎﺕ ﺩﺭ ﻳﻚ ﻧﺮﻭﻥ ﻣﺼﻨﻮﻋﻲ12
1.8تاریخچه شبکه عصبی مصنوعی15
1.9ساختار شبکه عصبی17
1.10سبک های معماری شبکه عصبی19
1.11انواع شبکه عصبی19
1.11.1 شبکه پرسپترون:20
1.11.2 شبکه همینگ20
1.11.3 شبکه خود سازمانده مدل کوهنن22
1.12یادگیری در شبکه عصبی25
1.12.1یاد گیری توسط شبکه عصبی مصنوعی25
1.13مسائل مناسب برای یاد گیری عصبی26
1.14انواع یاد گیری برای شبکه عصبی27
1.14.1یاد گیری با ناظر27
1.14.2یاد گیری تشدیدی .............28
1.14.3یاد گیری بدون ناظر29
1.15چرا از شبکه عصبی استفاده می کنیم29
1.16شبکه عصبی در مقایسه با کامپیوترهای سنتی30
1.17مسائل در خور شبکه عصبی مصنوعی31
1.18کاربردهای شبکه عصبی مصنوعی32
1.19مزایا و معایب شبکه عصبی33
1.20نرم افزار ها وسخت افزار های شبکه عصبی34
2 فصل دوم پیدایش بیو انفرماتیک...35
2.1تعریف بیوانفورماتیک37
2.2پایگاه داده37
2.3زیست شناسی محاسباتی38
2.4انواع داده های بیوانفورماتیک40
2.5حوزه فعالیت بیوانفورماتیک41
2.6ژنومیک(ژنومیکس)41
2.7پروتئومیک ( پروتئومیکس)41
2.8ابزارهای تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک42
2.9زمینه های بیوانفورماتیک43
2.9.1تحلیل توالی های ژنوم:43
2.9.2پیش بینی ساختارسه بعدی پروتئین44
2.9.3تحلیل کارکردی در سطح ژنوم44
2.9.4ایجاد و مدیریت پایگاه های داده ای45
2.9.5مدل سازی ریاضی و فرایند های حیات45
2.10اهداف بیوانفورماتیک45
2.11موضوعات سیستم نرم افزاری بیو انفور ماتیک46
2.12 دو شغل در بیوانفورماتیک46
2.13پیشرفت علم بیوانفورماتیک47
2.14تعامل بیوانفورماتیک با سایر رشته ها47
2.15مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی48
2.16بیوانفورماتیک در ایران49
3فصل سوم:شبکه عصبی در بیوانفورماتیک ..50
شبکه عصبی در بیو انفرماتیک50
طراحی شبکه عصبی برای بیو انفورماتیک50
3.1کاربرد شبکه عصبی در بیوانفورماتیک52
3.2برنامه نویسی تشخیص منطقه و شناسایی ژن52
3.3 شناخت سیگنال های رونویسی وترجمه ..53
3.4ویژگی های دنباله تجزیه وتحلیل و طبقه بندی54
3.5پیش بینی ساختار پروتئین54
3.6پیش بینی پپتیدهای سیگنال55
3.7نمونه هایی از کاربرد شبکه عصبی در بیوانفورماتیک55
3.7.1درخت های تصمیم گیری:55
3.7.2ماشین بردار پشتیبان56
3.8نتیجه گیری57
3.9 منابع57